本所置所長一人，綜理所務，並指揮、監督所屬人員；副所長一人，襄助所長處理所務；主任秘書一人，負責各單位之協調及權責問題之核議等事宜；所內設置綜合規劃組、安全防災組、工程技術組、環境控制組等4組，及秘書室、人事室、主計室等3室。
內政部建築研究所組織架構圖
